Le Thouet est irrigué par mille secrets. Sa source est le refuge des écrevisses à pattes blanches, son lit accueille des espèces rares telles le chabot ou la lamproie de Planer quand certains coteaux de sa vallée sont riches d’une flore méditerranéenne.
Un effort pour une meilleure connaissance de ces milieux écologiquement remarquables est aujourd’hui à l’œuvre. Parallèlement des opérations sont menées afin de lutter contre les espèces invasives comme le ragondin ou la jussie. Rappelant le lien historique entre l’homme et la rivière, les 115 ouvrages hydrauliques qui jalonnent le cours du Thouet sont aujourd’hui l’objet d’études et de travaux.
Dans le même but de préserver la biodiversité, un entretien est apporté à la végétation des berges et des sites vitrines accueillent de nouvelles plantations.